De stichting "Wij vertrouwen stemcomputers niet" heeft met een kort geding gedreigd in het geval de waterschappen de voorgenomen wijze van poststemmen tijdens de waterschapsverkiezingen doorzetten, aangezien dit in strijd met het stemgeheim is. De waterschappen zijn van plan om van 13 tot en met 25 november 2008 landelijke waterschapsverkiezingen te houden, waarbij de kiezers per post kunnen stemmen. Bij deze verkiezingen willen de waterschappen bij het tellen van de stemmen gebruik maken van codes op de stembiljetten. De codes zijn gekoppeld aan de naam en het adres van de kiezer. Hierdoor is het mogelijk voor de waterschappen om het stemgeheim van de kiezer te schenden. De stichting "Wij vertrouwen stemcomputers niet" vindt dat hierdoor geen sprake is van een werkelijk geheime stemming, zoals de Waterschapswet die voorschrijft.

Eerder wilde staatssecretaris Huizinga geen waterschapsverkiezingen via internet toestaan omdat het gebruikte stemsysteem (RIES) niet betrouwbaar genoeg is. De waterschappen gebruiken hetzelfde RIES nu om de codes op de stembiljetten te genereren. De stichting vindt dit ernstig omdat met ingang van deze waterschapsverkiezingen een 'lijstenstelsel' wordt ingevoerd. Hierdoor doen ook de landelijke politieke partijen voor het eerst mee met de waterschapsverkiezingen. Daarmee legt schending van het stemgeheim bij waterschapsverkiezingen ook informatie bloot over de politieke voorkeur van de deelnemende kiezers.

De actiegroep van Rop Gonggrijp heeft een brief naar de waterschappen gestuurd, maar verwacht niet dat die hier gehoor aan geven. Wij vertrouwen Stemcomputers niet adviseert de waterschappen om gebruik te maken van een andere beproefde methode van poststemmen die het stemgeheim wel waarborgt: de zogenaamde envelop-in-envelop procedure.